無論是分體的發生器還是組合的發生器，都需要對輸出的氣體進行干燥凈化。現有的除濕除烴方法基本都采用吸附劑吸附法，吸附劑大體都采用變色硅膠、分子篩和活性炭。由于使用變色硅膠除濕，需要定期觀察硅膠的變色程度，采用透明的有機玻璃材料或者碳酸脂成為，不銹鋼管由于不能隨時觀察硅膠的顏色不太適用。
過濾管的安裝樣式
1)吊裝式：凈化管的進氣口和出氣口都分布在機器的頂部，出管口向下，從電解池或者壓縮機過來的氣體首先從端蓋中間的進氣口向下通過內襯芯管進入干燥劑底部，然后經過吸附劑的過濾后再從向上返回到端蓋周邊的出氣口，從而保證氣體經過有效的過濾后再輸出。
2)立裝式：凈化管的進氣和出氣口都在機器底部、開口向上，從電解池或者壓縮機過來的氣體首先從端蓋中間的進氣口向上通過內襯芯管進入干燥劑頂部，然后經過吸附劑的過濾后再從向下返回到端蓋周邊的出氣口。采用不銹鋼材料的干燥器，通常會在不銹鋼管內增設一個內襯有機玻璃襯管。
由于受工作原理的限制，氮氣發生器和氫氣發生器電解池出來的氣體濕度都比較大，當氣體經電解池后或多或少都會有水汽凝結成水珠、采用立裝方式固定干燥器，液滴由于重力的作用，可能會在更換過濾器時滴入出氣口，進入色譜儀的管道，造成管路系統的污染。吊裝方式基本避免了以上的問題。么能公司現有的干燥過濾器*采用吊裝方式。
有些廠家為了降低電解分離池輸出氣體的濕度，在電解池和凈化管之間加裝了汽水分離器，由于分離器內的過濾材料多為燒結的粉末金屬材料，電解池輸出的未干燥氣體為堿性氣體，堿性氣體會腐蝕分離器內的過濾片甚至造成堵塞，影響發生器的正常使用，情況可能會由于堵塞造成壓力過高引起爆炸，希望用戶使用時一定注意。
