ELISA在評估線粒體功能時，常常要用到監控線粒體膜電位的探針，就是大家常常提到的JC-1、Rhodamine 123等。然而，在使用過程中，還需要仔細考慮多個控制，以及非質子電荷對染料行為的影響，才能正確地闡釋結果。為此，美國羅徹斯特大學醫學及牙醫學院的研究人員撰寫了一篇使用指南，討論了實驗過程中一些重要的技術考慮、控制以及平行互補分析。文章發表在一期的《BioTechniques》上。
近年來，測量線粒體膜電位的熒光染料已成為常用的工具，來監測重要的線粒體參數的改變。線粒體膜電位本身是細胞健康或受損的重要指示劑。而這些染料一般是親脂性陽離子化合物，它們在線粒體膜基質空間中積累，呈反比。
測量線粒體膜電位的染料有很多種，包括TMRM、TMRE、Rhodamine 123、DiOC6（3）、JC-1等，每一種都有其優勢和劣勢。ELISA作者在文章中就介紹了常用染料的優勢以及潛在的困難，并強調了在生命科學研究中突出其有效應用的*方法。
對于如何計劃實驗，作者也給出了具體的建議。ELISA通常有兩種類型的實驗：*種，在細胞或組織的慢性處理之后，ELISA研究人員希望確定如何改變；第二種，研究人員希望監測急性處理相對應的Δψm變化。盡管乍一看，第二種方法似乎更為困難，但實際上每個樣品/條件都能充當急性處理前的基線或內對照，因此通常能提供更容易闡釋的結果。作者還詳細討論了兩種方法的考慮因素。
